长病假工资扣完五险一金后仅600元，可能存在以下法律风险。
1. 基本生活保障风险：若当地最低工资标准为1000元，劳动者扣完五险一金后仅得600元，低于标准400元，将直接影响衣食住行等基本生活开支，导致生活质量下降；
2. 社保权益受损风险：若用人单位为降低成本，故意压低病假工资计算基数（如按当地最低工资而非劳动合同约定工资计算），可能导致五险一金缴费基数降低，长期下来影响养老保险个人账户积累、医疗保险报销比例等社保权益。
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长病假工资扣完五险一金后仅600元的处理，可能受以下特殊情况影响。
1. 用人单位有特殊福利政策：若用人单位在劳动合同或员工手册中约定“病假期间额外发放生活补贴”，且补贴与600元合计后不低于当地最低工资标准，则原600元工资的扣除行为可能被认定为合理；
2. 劳动者与用人单位书面约定低于最低工资：若劳动者因个人原因（如希望保留岗位）与用人单位签订书面协议，同意病假工资扣完五险一金后低于当地最低工资标准，且协议内容不违反法律强制性规定（需结合具体条款判断），则用人单位可能以此抗辩，影响劳动者维权结果；
3. 地方性法规有特殊规定：部分地区对病假工资有特殊要求（如上海规定“连续病假6个月内，工龄满8年及以上的，按本人工资100%发放”），若当地法规对病假工资比例有更高要求，用人单位未按规定执行，将直接导致工资偏低，需优先适用地方性法规处理。
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长病假工资扣完五险一金后剩余600元的合理性，可依据《劳动法》《最低工资规定》等法律法规判断。
根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条：“国家实行最低工资保障制度。用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。”《最低工资规定》第十二条明确：“在劳动者提供正常劳动的情况下，用人单位应支付给劳动者的工资在剔除下列各项以后，不得低于当地最低工资标准：（一）延长工作时间工资；（二）中班、夜班、高温、低温、井下、有毒有害等特殊工作环境、条件下的津贴；（三）法律、法规和国家规定的劳动者福利待遇等。”
本案中，长病假工资扣完五险一金后剩余600元，需先确认当地最低工资标准：若当地最低工资标准≤600元，则符合“工资不低于当地最低工资”的法定要求，扣除行为合理；若当地最低工资标准＞600元，则用人单位违反上述规定，扣除行为不合理。
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长病假工资扣完五险一金后仅600元时，部分劳动者的错误操作可能导致权益受损。
1. 未核实最低工资标准直接默认合理：部分劳动者因不了解当地最低工资标准，误以为600元是合法工资，放弃维权，导致长期领取低于法定标准的工资，影响基本生活；
2. 未保留关键证据：如未留存病假证明、工资条或劳动合同，后续投诉或仲裁时无法证明用人单位的违规行为，导致权益无法得到支持；
3. 超过仲裁时效才维权：劳动争议仲裁时效为1年，若劳动者在知道工资违规后超过1年才申请仲裁，可能因时效届满丧失胜诉权。
若您存在上述错误操作或不确定如何补救，建议及时咨询专业律师，避免权益进一步受损。

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